بدأت نيابة امن الدولة العليا التحقيق مع 25 متهما في تنظيم تابع لجماعة التكفير والهجرة في محافظتي القاهرة والجيزة.على الرغم من دخول عناصرها في عمليات المراجعات الفقهية قبل 5 سنوات. وشهدت التحقيقات -حسبما ذكرت صحيفة المصري اليوم في عددها الصادر الاحد- مع مفتي المجموعة ويدعى الشيخ محمد السيد مصطفى وثلاثة اخرين فقط، في القضية التي حملت رقم 488 حصر أمن دولة عليا. وشملت الاتهامات للتنظيم بدعوة الى تكفير المجتمع لعدم تطبيق الشريعة الاسلامية، تكفير الاقباط والدعوة الى حمل السلاح. وذكرت الصحيفة ان اجهزة الامن قد ألقت القبض عليهم في فبراير 2009، ومن المتوقع ان تشهد التحقيقات مفاجآت كبيرة عن علاقة التنظيم بدول عربية واخرى اسلامية. كما اشارت الى ان السلطات الامنية تحفظت على منشورات وكتب فقهية واجهزة كمبيوتر تحمل الدعوة لتنظيم التكفير والهجرة. تجدر الاشارة الى ان اخر تنظيم لجماعة التكفير والهجرة كانت السلطات الامنية قد ألقت القبض عليه عام 2004 وجميع افراده من محافظة القليوبية وبالتحديد من شبين القناطر، وتم الافراج عنهم بعدما اعلن عدد من قيادات التنظيم الانضمام الى المراجعات الفقهية التى اجراها تنظيما للجماعة الاسلامية والجهاد.