أكد الأمين العام لمجمع البحوث الإسلامية الدكتور محيي الدين عفيفي أحمد، في أول رد فعل على القضايا المثارة عبر الفضائيات المصرية حول صحيح البخاري، أن مجمع البحوث الإسلامية هو الهيئة العليا للبحوث الإسلامية في الأزهر الشريف، حيث يقوم المجمع بالدراسة في كل ما يتصل بالبحوث الإسلامية وبيان الرأي فيما يجد من مشكلات مذهبية أو اجتماعية . وأضاف في بيان له اليوم أنه انطلاقاً من هذا الدور فإن مجمع البحوث الإسلامية يعمل الآن على بيان الرأي العلمي حول القضايا التي تمت إثارتها مؤخراً، والتي تتعلق ببعض مسائل العقيدة وبصحيح البخاري والشبهات المثارة حول بعض الأحاديث النبوية وبعض الصحابة، وذلك من خلال ردود علماء الأزهر الشريف على هذه الشبهات، وطباعة تلك الردود في كتيبات صغيرة الحجم تكون متاحة وميسرة للجميع .
وأفاد أمين عام مجمع البحوث الإسلامية بأنه ستتم أيضًا عملية تسجيلات فيديو لردود علماء الأزهر على تلك الشبهات وتلك القضايا ليتم عرضها على اليوتيوب ، وبوابة الأزهر الإلكترونية ؛ لتكون متاحة للعامة والخاصة من المسلمين سواء داخل مصر أم على مستوى العالم انطلاقا من عالمية الأزهر الشريف ومواكبة للمستجدات، وتلبية لاحتياجات الناس قاطبة في التعرف على المعالم الحقيقة للإسلام من خلال المنهج الوسطي للأزهر الشريف .