أعلن السفير إيهاب فهمي -المتحدث الرسمي باسم رئاسة الجمهورية- أن الرئيس محمد مرسي قد كلف اللواء محمد إبراهيم -وزير الداخلية- بمتابعة أحداث الكاتدرائية المرقسية بالعباسية وتأمين المواطنين. وأكد فهمي -خلال مداخلة هاتفية ببرنامج "مصر الجديدة" الذي يُذاع على قناة الحياة 2- أن الرئيس أمر بإجراء تحقيق فوري حول الاشتباكات التي وقعت أمام الكاتدرائية وإعلان نتائجه على الرأي العام. وأشار فهمي إلى أن الرئيس مرسي أكد خلال اتصاله بالبابا تواضروس الثاني -بابا الإسكندرية وبطريرك الكرازة المرقسية- أن أي اعتداء على الكاتدرائية هو اعتداء عليه شخصيا. وكان الرئيس محمد مرسي قد أجرى اتصالا بالبابا تواضروس الثاني؛ للاطمئنان على الكاتدرائية، والتأكيد على متابعته للأحداث الجارية بالعباسية.