استنكرت هيئة علماء المسلمين الاعتداء الآثم الذي تعرض له جامع أم القرى ومقرها في بغداد. واتهمت الهيئة المليشيات الطائفية بشن هذا العدوان الإرهابي على الجامع وعلى مقر الهيئة. وحملت كامل المسؤولية عنه - وعن أي اعتداء آخر قد يتعرض له الجامع والمقر - للجهات التي تقف وراء هذه المليشيات وتوجهها للقيام بمثل هذا الاعتداء مستغلة ظروف الاحتلال ونفوذها في الأجهزة الأمنية. كما حملت الهيئة قوات الاحتلال والحكومة الجديدة المسؤولية ذاتها عن هذا الاعتداء بسبب عدم حسم موضوع المليشيات بصورة فعلية حتى استفحل أمرها وانتشر فسادها في عموم البلاد بما تتلقاه من دعم وإسناد كاملين بكل الوسائل والإمكانات من دول جارة ومن الجهات التي لا تريد للعراقيين أن يعيشوا في بلادهم بأمن وسلام. يذكر أن هذا الاعتداء وقع قبل الساعة الواحدة ظهراً واستغل المهاجمون المنازل المهجورة والمعروفة بالهياكل للقيام به حيث اتخذوا منها مواقع لشن هجوم محتمل آخر. وقد تمكن حراس الجامع والهيئة من التصدي بشجاعة للمعتدين الإرهابيين وردوهم على أعقابهم.