تعددت الأقاويل حول الملفات الشائكة وأهم القضايا أمام مجلس الوزراء الجديد بعد تعيين المهندس شريف إسماعيل، وزير البترول في عهد حكومة محلب وذلك بعد قبول الرئيس عبد الفتاح السيسي استقالة المهندس إبراهيم محلب من رئاسة مجلس الوزراء. الخبراء والمحللون حددوا عددًا من القضايا التي يجب أن يبدأ بها رئيس مجلس الوزراء الجديد عمله، الخبير السياسي الدكتور قدري إسماعيل، عميد كلية السياسة والاقتصاد، جامعة الإسكندرية، حدد عددًا من القضايا التي اعتبرها ملفات شائكة أمام شريف إسماعيل أبرزها انهيار الاقتصاد خاصة بعد انخفاض سعر الجنيه وتأثيره السلبي على الاستثمار بالإضافة إلى انخفاض حجم الصادرات بشكل ملحوظ فضلاً عن مشكلة ارتفاع الأسعار بشكل غير مسبوق وتفاقم مشكلة البطالة التي لم تفعل حكومة محلب شيئًا لحلها. وأضاف قدري في تصريحات خاصة ل"المصريون" أن من ضمن التحديات أيضًا أمام رئيس مجلس الوزراء الجديد مشكلة الأمن وحفظ الاستقرار فى الشارع المصري، والانهيار الخدمي في المصالح الحكومية الذي وصل في بعض الأحيان إلى التعطيل المتعمد بالإضافة إلى ضرورة القضاء على الفساد، مشيرًا إلى أن حكومة إسماعيل تواجه تحديات أصعب مما واجهتها حكومة محلب نتيجة قضايا الفساد التي تم اكتشافها مؤخرًا والتي كانت سببًا في توجيه أصابع الاتهام إلى كل من يتولي منصبًا في الحكومة بداية من رئيس مجلس الوزراء إلى جميع الوزراء بلا استثناء. وتابع أن تغييرات جوهرية يجب أن يقوم بها إسماعيل لتطوير مناهج التعليم الفاسدة والنهوض بالثقافة والإعلام وتعديل الخطابات الدينية المتشددة التي تملأ المدارس والجامعات ودور العبادة في مصر بالإضافة إلى وضع حد لانهيار الخدمات الإدارية ومؤسسات الدولة المنهارة بعد ثورة يناير حتى الآن. وأوضح قدري أن المواطن العادي يجب أن يشعر بتحسن في مستوى المعيشة عن ذي قبل خاصة مع افتتاح قناة السويس والتي لم يشعر بنتائجها أي أحد حتى الآن. توفير فرص حقيقية للشباب وتحقيق نمو اقتصادي وتحقيق العدالة الاجتماعية وانتشار الديمقراطية، أهم الملفات أمام رئيس الوزراء الجديد بحسب الدكتور محمد السعدني، الخبير السياسي، نائب رئيس جامعة مصر للعلوم والتكنولوجيا، بالإضافة إلى تحسن مستوى معيشة الفرد والمجتمع وبناء إستراتيجية جديدة وقوية تكون قادرة على مواجهة التغيرات الدولية التي تمر بها مصر والمنطقة العربية. وطالب السعدنى رئيس مجلس الوزراء الجديد باستيعاب الدرس وعدم الوقوع في أخطاء محلب في اختيار معاونيه وأن يختار وزراءه بعناية فائقة حتى لا يدفع ثمن هذه الأخطاء من تاريخه مؤكدًا أن محلب أخطأ عندما اختار وزراء ليسوا على قدر المسئولية مثل وزير الزراعة المقال وعلاقاته المشبوهة، مشيرًا إلى أن اختيار الوزراء بعناية يساعد شريف إسماعيل على مواجهة التحديات الكبيرة التي تنتظر حكومته. وفي سياق متصل يرى الدكتور مغاورى شحاتة، رئيس جامعة المنوفية الأسبق، أن أهم التحديات التي تواجه الحكومة الجديدة هى ملف المياه وسد النهضة والسدود الإثيوبية، مشيرًا إلى أن رئيس الوزراء المكلف يجب أن يتعامل بحكمة مع هذا الملف الشائك الذي يهدد مصر بالجفاء مشيرًا إلي أن نجاح الوزارة الجديدة في حل أزمة المياه يرفع رصيده كثيرًا لدي الشارع المصري. وأضاف شحاتة أنه من الملفات التي تنتظر حلولا من رئيس الوزراء الجديد أيضًا إعادة صياغة المنظومة الإدارية ومعالجة الأوضاع المتردية من حيث البطالة والفقر والتنمية مشيرًا إلى أن التعليم يحتاج إلى ثورة حقيقية خاصة أن وزير التعليم في الحكومة المستقيلة تسبب في زيادة انهيار العملية التعليمية في مصر.