تقدم الدكتور محمد شفيق بمستشفيات جامعة القاهرة ببلاغين للنائب العام اتهم في الأول- تحت رقم 7590 لسنة 2011- الدكتور أشرف محمود إبراهيم حاتم وزير الصحية بأنه قام بتاريخ 22/11/2010 وهو يشغل منصب مدير عام مستشفيات جامعة القاهرة باستغلال منصبه الوظيفي الحكومي بشكل يمثل إساءة لاستعمل السلطة. وقال إن ذلك جاء عندما قام بإعطاء تعليمات للوحدات داخل مستشفى جامعة القاهرة بإعداد كشوف بأسماء العاملين، وذلك حسب توزيع دوائرهم الانتخابية، لدعم مرشحة الحزب "الوطني" الحاكم سابقًا، وتدعى الدكتور مديحة خطاب. وأضاف أنه تم إعداد كشوف بأسماء العاملين وتوزيع دوائرهم الانتخابية الأمر الذي يشكل جريمة استعمال السلطة في غير محلها وكذلك إهدار المال العام في استغلال إمكانيات مستشفيات جامعة القاهرة. وأشار إلى أن ذلك ثابت بالأوراق والمخاطبات بين اللجنة النقابية للعاملين بمستشفيات جامعة القاهرة وبين وزير الصحة أثناء عمله مديرا عاما مستشفيات جامعة القاهرة. كما اتهم في بلاغ ثاني- رقم 7592 لسنة 2011- مدير الحجر الصحي بمطار القاهرة، لإصداره قرار باستخراج تصريح جمركي لمساعدة مهندس بوزارة الصحة يعمل بالإدارة العامة للحجر الصحي (خارج المطار). واعتبر أن القرار مخالف للقانون، وأن تراخيص التصريح الجمركي تصدر للأطباء العاملين بالحجر الصحي فقط، وأن الخروج عن ذلك يمثل إساءة استعمال السلطة. وحذر من خطورة هذا التصريح لأنه يتم استغلاله في غير موضعه، لأنه بموجب هذا التصريح يتم الدخول والخروج بدون تفتيش أو رقابة حتى مهبط الطائرات. وطالب مقدم البلاغين من النائب العام باتخاذ إجراء قانوني ضد وزير الصحة الحالي وحماية الدولة والمال العام. كما طالب بالتحقيق مع مدير الحجر الصحي بمطار القاهرة في المخالفات المنسوبة إليه مطالبا النائب العام المحافظة على المال العام.