نشبت أزمة بين حزب الحرية والعدالة وجامعة المنوفية بعد اتهام المهندس أشرف بدر الدين، عضو اللجنة المالية بمجلس الشورى، إدارة الجامعة بإهدار المال العام. و قال الدكتور أحمد زغلول، رئيس جامعة المنوفية, من يمتلك مستندات تثبت أي مخالفات أو تجاوزات مالية بالجامعة عليه أن يتقدم بها للنيابة العامة واتخاذ كافة السبل القانونية بشأنها, وذلك ردًا على تصريحات النائب أشرف بدر الدين، عضو اللجنة المالية بمجلس الشورى، والتي تفيد بامتلاكه مستندات تؤكد صرف جامعة المنوفية مبلغ 196 ألف جنيه كمكافآت من صندوق خاص للجامعة خلال 3 أشهر فقط. وفي السياق، أكد الدكتور رفعت البدري، المستشار الإعلامي للجامعة، خلال تصريحات صحفية على أنه لا توجد أية مخالفات مالية بالجامعة أو صرف المكافآت دون وجه حق, مؤكدًا أن صرف المكافآت حق أصيل لرئيس الجامعة في حالات محددة بالقانون, مضيفًا أن من يمتلك مستندات تثبت عكس ذلك, عليه أن يقدمها فورًا للنيابة العامة.