يواجه الدكتور كمال الجنزوري أزمة جديدة بسبب قراره الخاص بتعيين وزير الصحة السابق في عهد حكومة عصام شرف الدكتور أشرف حاتم في منصب أمين عام المجلس الأعلى للجامعات، حيث هدد أعضاء هيئة تدريس الجامعات بإرسال مذكرة احتجاج للمجلس الأعلى للقوات المسلحة بهذا الأمر، وذلك لأن "حاتم" ورد اسمه فى تقرير لجنة تقصى حقائق "موقعة الجمل"، حيث اتهم بأنه جلب أطعمة ومأكولات لبلطجية الموقعة، ومعروف بأنه تم عزله من منصب وزير الصحة فى حكومة شرف الثانية؛ بسبب ورود اسمه في هذا التقرير. يذكر أن وزير التعليم العالى الدكتور حسين خالد كان قد رفع قائمة مقترحة بالأسماء المرشحة لتولي هذا المنصب وكان على رأسها الدكتور أشرف حاتم والدكتور عبد الجليل مصطفى، وقام الوزير بتزكية أشرف حاتم للمنصب.