بدأت عمليات الفرز بالدائرة الخامسة بمركز شباب البراجيل والدائرة الثالثة بمركز شباب إمبابة بالرغم من عدم دخول جميع صناديق الاقتراع إلى مقر لجنة الفرز، وسمح لمندوبي المرشحين بالدخول بعد سيطرة الشرطة العسكرية على اللجان. ومنعت قوات الأمن مندوبى المرشحين من الدخول الى مقار لجان الفرز في البداية بسبب الزحام الشديد أمام اللجان بالدائرتين والذى تسبب فى إدخال صناديق الأقتراع بصعوبة. وكان أنصار المرشحين ومندوبيهم تجمهروا أمام مقر لجنة الفرز مما سبب فوضى عارمة تم احتواؤها .