شهدت خطوط المترو الثلاثة تشديدات أمنية مكثفة منذ بداية ساعات التشغيل، حيث انتشر رجال إدارة شرطة النقل والمواصلات على الأرصفة وفي المحطات وبين الركاب لإحكام عملية التأمين. كما انتشر أفراد الشرطة السريين داخل العربات لتوسيع دائرة الاشتباه والقبض على من تسول له نفسه بإثارة الشغب وتكدير السلم العام خلال احتفالات افتتاح قناة السويس الجديدة، أضافه إلى التفتيش المستمر للحقائب والمنقولات اقبل الدخول إلى المحطة بواسطة أجهزة الإكس رأس والتفتيش اليدوى والبوابات الإلكترونية.