بعد إعلان نتيجة الانتخابات الرئاسية صرح المطران الدكتور منير حنا أنيس رئيس الطائفة الأسقفية بمصر والشرق الأوسط، بأنه يحترم النتائج التى أعلنتها اللجنة العليا للأنتخابات الرئاسية وقدم التهنئة للدكتور محمد مرسى بفوزه فى انتخابات رئاسة الجمهورية. وقال كما يعلمنا الكتاب المقدس فإننا سوف نصلى من أجله حتى يستطيع أن يحقق أحلام شعب مصر التى تشمل الحرية والديمقراطية وتحقيق حقوق المواطنة وتطبيق العدالة الاجتماعية والمساواة بين أبناء الوطن الواحد. وأضاف ننتظر من الرئيس الجديد أن يحقق كل وعوده وتعهداته لشعب مصر بمسلميه ومسيحييه، وقال كما نتمنى أن يعطى الدكتور مرسى أولوية خاصة لملف الأقباط والوحدة الوطنية لأنه منذ اندلاع ثورة 25 يناير لم يهتم أحد بهذا الملف. وأشار إلى أن للوحدة الوطنية أهمية قصوى فى المرحلة القادمة لأن بدونها لاتتحقق التنمية، كما أرسل الدكتور القس بطرس فلتاؤس رئيس الطائفة المعمدانية الكتابية الأولى بمصر برقية تهنئة للدكتور مرسى بفوزه فى الرئاسة كأول رئيس منتخب بعد ثورة 25 يناير المجيدة. فيما ناشد فلتاؤوس فى برقيته الرئيس الجديد محمد مرسى بأن يكون حاكما عادلا لا يميز بين مواطن وآخر، وأن يهتم بالفقراء والمعدومين والعاطلين، وأن يجد حلولا لكافة المشكلات الصحية التى يعانى منها المواطن المصرى. كما طالب فلتاؤس من الرئيس الجديد إصدار عدة قوانين يحتاجها مسيحيى مصر مثل قوانين الأحوال الشخصية ودور العبادة الموحد ومكافحة التمييز فى الوظائف. وقال فى برقيته "نحن نصلى من أجل أن الله يسندك فى مهمتك الجديدة من أجل سلام مصرنا".