هنأ مجلس شورى العلماء الدكتور محمد مرسى بالفوز فى الانتخابات الرئاسية على الفريق أحمد شفيق، وقال المجلس، فى بيان رسمى له، "لقد سعدنا سعادة غامرة حينما تلقت أسماعنا النبأ السعيد بفوز الدكتور محمد مرسى فى الانتخابات الرئاسية". وأضاف البيان، "نقول له سر على بركة الله، فنحن معك فى طاعة الله وخدمة شعب مصر، وفقك الله لحمل هذه الأمانة على الوجه الذى يرضيه وسدد خطاك وأصلح بطانتك وجعل الخير والبركة على يديك، ونقول له كن مع الله يكن الله معك".