أمر المستشار هشام بركات النائب العام بإحالة المرشد العام لجماعة الإخوان الإرهابية محمد بديع و104 أشخاص من القيادات الوسطي وعناصر تنظيم الإخوان إلي محكمة الجنايات لاتهامهم بارتكاب أحداث العنف بالإسماعيلية والتخطيط لاحتلال مبني ديوان عام المحافظة باستخدام الأسلحة النارية وقتل3 مواطنين والشروع في قتل16 آخر عقب ثورة30 يونيو مع استمرار حبس المتهمين احتياطيا وسرعة ضبط وإحضار30 متهما هاربا وحبسهم علي ذمة القضية. ووجهت النيابة العامة للمتهمين تهم الانضمام لجماعة أنشئت علي خلاف أحكام القانون والدستور والقتل العمد والشروع فيه والبلطجة واستعراض القوة ومحاولة احتلال مبني حكومي باستخدام القوة وتخريب الممتلكات العامة والخاصة عمدا والترويج لأغراض جماعة إرهابية وحيازة أسلحة وذخيرة وأدوات التعدي علي المواطنين. كشفت تحقيقات النيابة العامة أن المرشد العام للتنظيم الإرهابي عقد مع قيادات الجماعة عدة اجتماعات انتهت إلي قرار بمواجهة الدولة وأجهزتها وعقاب المواطنين علي قيامه بثورة30 يونيو ضد الرئيس المعزول ومنعهم من استكمال فعالياتها وإحداث حالة من الفوضي والانفلات بالبلاد. وأضافت التحقيقات أن مكتب الإرشاد أصدر تكليفات إلي القيادات الوسطي بالجماعة بمحافظة الإسماعيلية لتنفيذ ذلك المخطط بالتنسيق مع عناصر من الجماعات والتيارات الإرهابية والمتطرفة. وأشارت التحقيقات إلي أن تلك الجماعات المتطرفة تولت دعم عناصر تنظيم الإخوان بالأسلحة النارية والبيضاء والخرطوش والعبوات الحارقة. وأوضحت التحقيقات أنه تم الاتفاق علي تجمع عناصر وقيادات الجماعة الإرهابية يوم الجمعة2013/7/5 بشارع شبين الكوم وقطعوا الطرق في الاتجاهين وتوجهوا إلي مبني ديوان عام المحافظة بمنطقة الشيخ زويد وأزالوا الأسلاك الشائكة المحيطة به واشتبكوا مع قوات التأمين من الجيش والشرطة والأهالي وأطلقوا النيران صوبهم بكثافة وقذفوهم بالحجارة وزجاجات المولوتوف وحاولوا اقتحام مبني المحافظة واحتلاله وخربوا سيارات عامة وخاصة. وأضافت التحقيقات أن قوات الشرطة تمكنت بمساعدة الأهالي من ضبط75 متهما بحوزتهم بندقية آلية وذخيرة بخلاف المطبوعات المناهضة لأجهزة الدولة وتروج لأغراض الجماعة الإرهابية. كما انتهت النيابة العامة من الاطلاع علي تقارير الطب الشرعي التي أثبتت أن وفاة المواطنين الثلاثة حدثت نتيجة إصابتهم بطلقات نارية أحدثت بهم تهتكات بالكبد والرئة والقلب والصدر وأن جميع الإصابات بالمواطنين الآخرين ناتجة عن طلقات نارية وخرطوش وتسببت ببتر إصبعين لأحد المصابين. كما انتهت النيابة العامة من معاينة أماكن الأحداث وممتلكات المواطنين التي تم إتلافها ومناظرة جثامين المواطنين الثلاثة واستمعت لأقوال المصابين.