قرر الدكتور أمين لطفي، القائم بأعمال رئيس جامعة بني سويف، أحقية تعيين المهندس أشرف خميس عبد الفتاح في العمل كمعيد بقسم المدني بكلية الهندسة بالجامعة، بعد استكمال مصوغات التعيين وتوقيع الكشف الطبي اللازم، بعد أن رفض الأمن تعيينه من قبل. يذكر أن المهندس أشرف خميس عبد الفتاح، تخرج من كلية الهندسة جامعة الفيوم عام 2006، وكان تقديره العام امتياز مع مرتبة الشرف، وترتيبه الثاني على الدفعة، إلا أن الكلية رفضت تعيينه لعدم موافقة الجهات الأمنية له، حيث جاء في تقريرها أنه كان مشاركا في مظاهرة مع طلبة الإخوان المسلمين ضد اتحاد الطلاب. كان ذلك وهو طالب في السنة الثالثة بالكلية، وتم تلفيق تهمة التظاهر له بناء علي كشف مدرج به اسمه رغم أنه كان موجودا في محاضرة بالكلية في هذا اليوم، وبشهادة الأساتذة وتوقيعه في كشف حضور المحاضرة ولم يكن ضمن المظاهرات. عندما أعلنت كلية الهندسة جامعة بني سويف عام 2008 عن حاجتها في شغل وظائف معيدين بالكلية بالأقسام المختلفة، تقدم بناءً على هذا الإعلان وتم قبوله لاستيفائه شروط الإعلان، وعين معيدا بقسم المدني بالكلية بالقرار رقم (179) لسنه 2009، إلا أن سيناريو الأمن تكرر مرة أخرى، وجاء التقرير الأمني برفض تعيينه، وحال ذلك دون استلامه العمل مره أخرى. وبعد ثورة 25 يناير تقدم المعيد بتظلم لرئيس الجامعة، وبعد رأي المستشار القانوني للجامعة بعدم قانونية التقارير الأمنية التي ليست من ضمن شروط التعيين، وافق رئيس الجامعة علي تسلمه العمل بالكلية بعد اكتمال مصوغات التعيين والكشف الطبي اللازم. من ناحية أخرى، عبر المهندس أشرف عن سعادته الغامرة بموافقة رئيس الجامعة لتسلمه العمل، وتسأل كيف يقف جهاز أمن الدولة أمام مستقبله؟، على الرغم من تفوقه في سنوات الدراسة.