أكدت فاطمة صلاح الدين ممثلة الجهاز المركزى للمحاسبات، أنه تم فحص الميزانيات الخاصة بالنقابة العامة للأطباء البيطريين، من 2006 وحتى 2011، وتم إعداد ملاحظات حولها وإرسالها لمجلس النقابة العامة، ولكن لم يتم الرد عليها ، ولم يتم إرسال ميزانية 2012 لمراجعتها حتى الآن. وأشار نادر عز الدين المراجع بالجهاز المركزى للمحاسبات، خلال إعمال الجمعية العمومية اليوم، إلي عدم قيام النقابة باستكمال مشروع شاليهات العريش حيث توقف من عام 2002 مما أدى إلى استرداد الأعضاء لمستحقاتهم ودخول النقابة لاستكمال المشروع بمبلغ 8 ملايين جنيه، موضحاً أن الجهاز أكتشف اختفاء مبلغ 1.5 مليون جنية من أموال النقابة، قام أمين الخزينة باختلاسها وقام الجهاز بإبلاغ النائب العام فى حينه. وأشار عز الدين إلى تحفظ الجهاز على قيام بعض الشركات بصرف بعض المبالغ المالية لبعض أعضاء مجلس إدارة النقابة الممثلين للنقابة فى مجالس إدارات تلك الشركات بصفتهم الشخصية كأرباح، وأكد على ضرورة مطالبة النقابة للشركات بتوريد تلك المبالغ لصالح صندوق النقابة مباشراً. وأشار الجهاز إلي وجود مديونية لدي شركة الشروق للتجارة بمبلغ 148 ألف جنيه منذ سنوات، ولم يتم اتخاذ الإجراءات اللازمة نحو الشركة، وتراخي مجلس النقابة في تحصيل مديونيات لدي أعضاء النقابة من معارض السلع المعمرة.