قال الدكتور عبد الحى عزب، رئيس جامعة الأزهر، إنه تم ندب الدكتور محمد عبد العاطى للقيام بعمل عميد لكلية الدراسات الإسلامية والعربية للبنات بالمنصورة، بناء على رغبته، لافتا إلى أنه قدم اعتذارا عن القيام بعمل عميد كلية التربية بنين بالقاهرة، حفاظا على علاقته بزملائه. كان الدكتور عبد الحى عزب، رئيس جامعة الأزهر، قد أصدر قرارا في يناير الماضى، بتعيين الدكتور محمد عبد العاطى، عميدا لكلية التربية بنين بالقاهرة، إلا أن هذا القرار قوبل بالرفض من قبل أساتذة الكلية، بحجة أن عبد العاطى، ليس تربويا، ويعمل أستاذا للدراسات الإسلامية.