قرر الشيخ "عبد الناصر نسيم عطيان" مدير "مديرية أوقاف الجيزة" وقف كلا من الشيخ "خالد أحمد مطر" إمام وخطيب "مسجد أبو خفاجي" التابع ل"إدارة أوقاف أطفيح" والشيخ "عمرو محمد عبد العزيز البنا" إمام وخطيب "مسجد الفتح" بأرض المطار "حي إمبابة" إدارة "شمال الجيزة" عن إلقاء الخطب والدروس مع نقله كل منهما إلى مقر الإدارة التابع لها لحين انتهاء التحقيقات معهما فيما هو منسوب للأول من تحريض ضد الجيش والشرطة, وتجاوز الثانى أثناء خطبة الجمعة وتحريض المصلين وإثارتهم لما يضر بأمن الوطن، والتعاطف مع جماعة إرهابية مما أثار الجمهور وأحدث اضطرابات بين المصلين. كما قرر فضيلة الشيخ "جابر طايع" مدير "مديرية أوقاف القاهرة" إحالة الشيخ "محمد أمين" إمام "مسجد علي سهل" ب"الباطنية" للتحقيق، لتقاعسه عن أداء خطبة الجمعة الموحدة، وتمكينه د. "محمود توفيق علي" أستاذ الفقه المقارن ب"جامعة الأزهر الشريف" من أداء خطبة الجمعة دون إذن مسبق من مدير المديرية، مما تسبب في حدوث بلبلة بين جماهير المسجد. كما قرر فضيلته وقف الشيخ "عبد الهادي" خطيب المكافأة ب"مسجد الرحمن" بشارع الملك الصالح ب"شبرا"، وسحب ترخيصه، لعدم التزامه بتوجيهات الوزارة بشأن خطبة الجمعة، وخروجه عما يجب أن يتحلى به العلماء والخطباء من سلوكيات وأخلاق بحسب الوزارة. وبشأن ما نشر يوم 14/5/2014 على بعض المواقع الإلكترونية من قيام محفظة قرآن ب"مسجد عبد العال" التابع ل"إدارة أوقاف إبشواي" ب"الفيوم" بطرد طفلتين ونهرهما لتصريحهما للمحفظة بأنهما يشجعان المشير "السيسي" في انتخابات الرئاسة، أوضحت الوزارة أن المسجد المذكور جار العمل به تحت التجديد، وما زالت أعمال التشطيبات النهائية به قائمة ليتسنى للوزارة استلامه وفتحه للمصلين، وأن المحفظة صاحبة الواقعة ليست من المنتمين إلى وزارة "الأوقاف"، وغير مصرح لها بالعمل، وقد تم أخذ تعهد على القائم بأعمال البناء بالمسجد بعدم تمكين أحد من المسجد أو ملحقاته لحين استلامه بمعرفة الوزارة. وتؤكد الوزارة أنها لن تسمح لغير أبنائها باختراق مساجدها أو المساس بالأمن الفكري لأبناء المجتمع والعمل على حمايته وتحصينه من جميع الأفكار الضالة والمنحرفة والمتشددة والمتطرفة.