قال الدكتور عبد الغنى هندى، منسق الحركة الشعبية لاستقلال الأزهر، إن التشكيل الجديد للأزهر يؤكد أخونة المجلس الأعلى للشئون الإسلامية، بدليل أن نفس الأشخاص الموجودين فى المجلس الأعلى للشئون الإسلامية هم أنفسهم المعينين فى الأوقاف، مضيفا، أنه بهذه الطريقة سيسيطر الإخوان على الأزهر . واستنكر هندى، فى تصريحاته للشروق، اليوم الإثنين، ضعف دور المجلس الأعلى للشئون الإسلامية، متسائلا عن دورهم وموقفهم من مشروع الصكوك المرتدة والفتاوى المتضاربة والدستور وتقنين الشريعة الإسلامية وتطوير الخطاب الدينى.