تضع مكتبة الخرائط بمكتبة الإسكندرية تحت تصرف روادها كما معرفيا هائلا من الخرائط والأطالس والكتب، بهدف خدمة الباحثين المتخصصين فى مجالات البحث الجغرافى والدراسات المعتمدة على استخدام الخرائط والمواد الخرائطية على اختلاف أنواعها. وتضم المكتبة نحو 6000 خريطة تجمع بين المجموعات الحديثة والخرائط التاريخية، وهى تغطى جميع أنحاء العالم بالتركيز على مدينة الإسكندرية وسائر مدن جمهورية مصر العربية والدول العربية والأفريقية ودول أوروبا المطلة على البحر المتوسط. وتحتوى المكتبة على أكثر من 500 أطلس، و200 كتاب، بالإضافة إلى ست كرات أرضية سياسية، ومناخية، وطبيعية، ومنها ما يوضح توزيع المعادن والأحجار الكريمة، وغيرها. ويعد من أهم مقتنيات مكتبة الخرائط خريطة «صورة الأرض» للشريف الإدريسى، وهى صورة طبق الأصل لخريطة العالم التى رسمها العالم العربى «الشريف الإدريسى»، أحد كبار الجغرافيين ومؤسسى علم الجغرافيا فى التاريخ، بناء على طلب الملك الصقلى روجر الثانى عام 1154، وقام بنشرها المجمع العلمى العراقى عام 1951. وتتضمن المكتبة أيضا نسخة طبق الأصل لخريطة مخطوطة للخليج العربى وبلاد ما بين النهرين، ويعود أصل هذه الخريطة إلى القرن السابع عشر. وتضم المكتبة جميع أنواع الخرائط من خرائط سياسية وطبيعية وطبوغرافية، بالإضافة إلى الخرائط المتخصصة موضوعيا كالخرائط الزراعية، والصناعية، وخرائط المواقع السياحية والأثرية وغيرها. وتحتوى مكتبة الخرائط على عدد من المواد الخرائطية والأجهزة، ومنها جهاز يدوى للمساحة التصويرية (فوتوجرامترى)، وهو جهاز إنتاج سبعينيات القرن العشرين ويستخدم لرسم الخرائط باستخدام الصور الجوية، كما يتيح الرؤية المجسمة للصور. وتوفر مكتبة الخرائط عددا من أجهزة الكمبيوتر لمساعدة الرواد على البحث فى مقتنيات المكتبة من خرائط وأطالس من خلال فهرس المكتبة الإلكترونية OPAC حيث يمكن البحث بعنوان الخريطة أو الجهة المصدرة أو التغطية الجغرافية أو موضوع الخريطة. وتحتوى المكتبة على جهاز كمبيوتر يضم برنامجى Celestia وWorldWind اللذين تتيحهما الإدارة الوطنية للملاحة الفضائية والفضاء بالولايات المتحدة «ناسا» NASA. ويتيح برنامج Celestia معلومات عن المجموعة الشمسية بأكملها والنظام الشمسى ومدارات الأقمار والفضاء، ويقدم معلومات عن المسافات الضوئية بين الكواكب وبعضها والشمس، بينما يمكن من خلال برنامج WorldWind الاطلاع على أى منطقة من مناطق الكرة الأرضية، مع إمكانية إضافة بيانات مثل أسماء الأماكن ومواقع الخدمات والظواهر الطبيعية، كما يتضمن صورا للآثار والمواقع السياحية. كما يحتوى الجهاز على برنامج «جوجل إيرث» Google Earth.