جامعة المنيا عقد مجلس جامعة المنيا برئاسة الدكتور محمد أحمد شريف رئيس الجامعة وبحضور نواب رئيس الجامعة وعمداء الكليات أعضاء بالمجلس حيث عرض رئيس الجامعة ما نسب إليه في مذكرة الرقابة الإدارية المقدمة إلي السيد رئيس مجلس الوزارء، وهي ملاحظات بنيت كلها علي أن رئيس الجامعة من الإخوان المسلمين وبالتالي أصبح كل ما يقوم به من أعمال اعتيادية تفسر علي أنها خدمة لجماعة الإخوان وهو في الحقيقة اتهام باطل ( على حد قول رئيس الجامعة ) وما بني علي الفرض الباطل من موضوعات فهو باطل واستعرض رئيس الجامعة المذكرات وأودع الردود علي المذكرتين بأمانة المجلس وهي مرفقة بتقرير المجلس. طالب بعض العمداء رئيس الجامعة باستمراره حتي انتهاء فترة رئاسته لأن الاستقالة تعني الاعتراف بما جاء في المذكرات السابق الإشارة إليها وعلي ذلك فيجب عليه الاستمرار. وأعرب بعض العمداء الآخرين عن تقديرهم لأداء رئيس الجامعة في الفترة الماضية وما تمير به من خلق رفيع وأمانة في العمل ودأب علي تحقيق المصلحة العامة في الجامعة ولمصر آملين أن يوفق الله عز وجل الجهات المعنية في كشف الحقائق وتحقيق مصلحة الوطن. وذكر عمداء آخرين أن رئيس الجامعة لم يتخذ قررات بدون الرجوع إلي مجلس الجامعة وأن الكل مسئول وان بعض القرارات التي كان يتخذها في فترات ما قبل انعقاد مجالس الجامعة بحكم سلطاته التي يخولها له القانون كان يشرحها لمجلس الجامعة التالي لهذه القرارات ولذلك رأي هؤلاء العمداء أن مجلس الجامعة يجب أن يصدر بيان تأييد لرئيس الجامعة واستنكار لما نسب إليه ووافق المجلس علي ذلك ولكن رئيس الجامعة شكر الجميع وذكر أنه يقدر مشاعرهم ولا يرغب في أي حرج لأي من أعضاء المجلس وطلب عدم إصدار هذا البيان. من الجدير بالذكران مجلس كلية الزراعة بجامعة المنيا كان قد وافق على طلب الدكتور محمد أحمد شريف رئيس جامعة المنيا الحالى والذى يعمل أستاذاً بالكلية بالنقل للعمل بكلية الزراعة بجامعة عين شمس . وقال رئيس الجامعه حينذاك انه قد تقدم بطلب النقل لأسباب وظروف خاصه , منها أن أسرتة تقيم بالقاهره , وأنه يفضل ان يقيم معهم , مضيفاً انه منذ أنتخابة كرئيس لجامعة المنيا ومواقفة ثابته ولم تتغير و انه واجهة الكثير من الضغوط والتحديات . يذكر أن طلب النقل الذي تقدم به رئيس الجامعه لايعني تخليه عن منصبه كرئيس جامعه , وأنه فقط يرغب في العمل كأستاذ بكلية الزراعه بجامعة عين شمس بعد بلوغه سن المعاش نهاية هذا العام , وأنه لا يرغب في التجديد له .