شيع الآلاف من أهالي دمياط وكفر سعد جنازة الشهيد محمد الشافعي، وحدثت أثناء تشيع الجنازة بعض المناوشات بين القوى السياسية المشاركة فيها، وردد المشيعون هتافات كان منها: "لا إله إلا الله.. الشهيد حبيب الله؛؛ القصاص.. القصاص". وفى الأثناء، رفض أعضاء التيار الشعبي المتواجدين بالمسيرة، مشاركة أي عضو من أعضاء جماعة الإخوان المسلمين في جنازة الشهيد محمد الشافعي.