أستنكر الدكتور مصطفي النجار ما أسماه تقسيم الدولة لمحافظات كافرة و مؤمنة، طالباً من الشيوخ و الدعاة توعية المواطنين، حيث قال: "الدعوة لتصنيف محافظات مصر إلى محافظات مؤمنة وأخرى كافرة هي دعوة لتقسيم مصر إلى دولتين هل يوافق دعاة الإسلام السياسي على هذا؟؟، ننتظر موقفا وطنيا". وأضاف العضو السابق لمجلس الشعب المنحل عن دائرة مدينة نصر، خلال تغريده له علي موقع التدوينات القصيرة «تويتر»: "أخطر ما في دعوة تقسيم المحافظات إلى مؤمنة وكافرة هي استمرار وجود فكر تكفير المجتمع وتقسيمه لفسطاط الإيمان وفسطاط الكفر، هل نرجع للوراء؟".
كما أنتقد في تغريدة سابقة الشيخ عبد الله بدر و وصفه بالكذب، موضحا أن تجار الدين يتساقطون. مواد متعلقة: 1. «النجار»: لا إعتراف بإستفتاء لا يشرف عليه القضاة 2. «النجار» ل«الرئيس»: لا نثق بكم ولستم مؤتمنون على إدارة الوطن 3. «النجار منتقداً الدستور»: صلاحيات مبارك هي من جعلته ديكتاتورًا