أصدر الرئيس محمد مرسى القرار الجمهورى رقم327 لسنة 2012 بنقل تبعية مستشفى أسوان التعليمى إلى مستشفى أسوان الجامعى. وتضمن القرار أن يكون المستشفى مقرا نظريا لكلية الطب للاستفادة بكل إمكانياتها، سواء كانت مباني أو أجهزة طبية أو كوادر بشرية، وذلك من أجل رفع مستوي الخدمة الطبية في أسوان وجنوب الصعيد وتشجيعا للسياحة العلاجية من أفريقيا خاصة والعالم العربي والدولي بشكل عام. هذا ما أكده الدكتور حسن عبد القادر، مدير مستشفى أسوان التعليمى, بأن إدارة المستشفي قد تلقت هذا القرار الجمهورى الخاص بنقل تبعية مستشفى أسوان التعليمى لجامعة أسوان . وقال: إنه جار نقل تبعية العاملين بالمستشفى من هيئة المستشفيات التعليمية إلى جامعة أسوان، مع تكليف وزارة الصحة بإتمام إجراءات النقل.