تسببت إعلانات حملة الدكتور محمد مرسى مرشح جماعة الإخوان المسلمين لرئاسة الجمهورية باستخدام اسم الشيخ محمد حسان فى الدعاية لمرسى بأنه أحد أكبر العلماء الداعمين، فى أزمة بين الجماعة والداعية السلفى الشهير، وقال مصدر من أسرة الشيخ إن حملات دعاية مرسى استخدمت اسم الداعية فى دعم مرسى، وهذا غير صحيح. وأضاف فى تصريحات ل«الوطن»، أن الشيخ حسان لم يعلن دعمه لأحد المرشحين على رئاسة الجمهورية سواء كان الدكتور محمد مرسى أو غيره، وكل ما يتردد عن دعمه لمرشح الإخوان فى الحملة الإعلامية فى الشوارع غير صحيح و«الشيخ حسان ليس لديه نية للتصويت أصلاً فى الانتخابات لعدم اقتناعه بأى مرشح سواء الذين استبعدتهم اللجنة العليا للانتخابات أو من الذين استقرت عليهم لخوض السباق الرئاسى». وقال: الشيخ حسان امتنع عن التصويت فى اجتماع علماء الهيئة الشرعية للحقوق والإصلاح التى تضم عدداً من العلماء لدعم أحد المرشحين للرئاسة، الذى انتهى إلى دعم الدكتور مرسى مرشح الإخوان، موضحاً أن الهيئة أعلنت دعم مرشح الجماعة لكن الشيخ حسان لم يعلن ذلك. وأكد المصدر أن مجلس شورى العلماء، الذى يضم الشيخ حسان، لم يحدد مرشحه للرئاسة، متسائلا: «لماذا أعلن الإخوان دعم الشيخ لمرشحهم». فى المقابل، قال الدكتور ياسر على، المتحدث باسم حملة مرسى: «الحملة لم تعلن أن الشيخ حسان أيّد للدكتور محمد مرسى، لكن حسان كان من بين أعضاء الهيئة الشرعية للحقوق والإصلاح التى أعلنت تأييدها لمرسى». وأضاف: «إذا كان حسان امتنع عن التصويت على قرار الهيئة بتأييد مرسى فنحن نحترم ذلك»