قال الدكتور هشام عرفات وزير النقل، إنه لا يعلم السبب الرئيسى وراء حادث قطار البدرشين، قائلًا: "الله أعلم حصل إزاي، والحمد لله إن مافيش وفيات، ده كرم كبير من عند ربنا"، مشيرا إلى أن مثل هذه الحوادث تحدث في بلاد أخرى وليس مصر فقط. وأضاف فى تصريحات إعلامية, أن اللجنة الفنية هي التي ستحدد أسباب وقوع حادث البدرشين، متابعًا: "الموضوع حساس جدًا لأنه يتعلق بالأمن والأمان والسلامة، والإشارات هى سبب الحادث". وأكمل: "اخترقنا المشكلة وقادرين على حلها، ولكن نحتاج إلى وقت، حيث يوجد لدينا مشاكل في السكك الحديد لعدم تطويرها منذ فترة طويلة"، مضيفا: "وإحنا داخلين في مشروعات تطوير خيالية".