حققت الهيئة العامة للمستشفيات والمعاهد التعليمية عدة إنجازات في خلال عام 2016، فقد استقبلت مستشفيات الهيئة ما يقرب 5ملايين و186 ألف مريض في أقسام الاستقبال والعيادات الخارجية، كما قامت بعمل أشعة تشخيصية لعدد 549 ألف مريض، وعمل أشعة موجات فوق صوتية لما يقرب 269 ألف مريض، وعمل الأشعة المقطعية لما يقرب553 ألف مريض، أما بالنسبة للمناظير تعدت 236 ألف مريض. كما قامت بعمل تحاليل لما يقرب 3 ملايين مريض، كما قامت الهيئة بعمل ما يقرب 173 ألف عملية من ضمنهم 823 عملية قلب مفتوح، و10282 عملية قسطرة قلب، و45 عملية زرع قوقعه، و31 عملية زرع كلي، و51 عملية زرع كبد، كما قامت الهيئة بعمل غسيل كلوي لعدد 2555 حالة، كما تم دخول 6149 حالة بقسم المبتسرين، وما يقرب 221 ألف حالة تم قبولهم بالأقسام الداخلية. ووصلت معدلات شغل السرائر بالهيئة إلي 51%، ووصلت متوسط نسبه مده الإقامة إلي 4 أيام. كما قامت الهيئة بالانتهاء من 14 مشروع وهم تطوير مستشفي شبين الكوم التعليمي بتكلفة 6مليون جنيه مصري، ومستشفي كبد المحلة بتكلفة 2مليون جنيه، ومعهد القلب القومي بتكلفة 51مليون جنيه، ومعهد بحوث الحشرات بتكلفة مليون جنيه، ومستشفي أورام الإسماعيلية بتكلفة 21مليون جنيه، ومستشفي الساحل بتكلفة 20مليون جنيه، والمعهد القومي للسكر والغدد الصماء بتكلفة مليون جنيه، ومعهد التغذية بتكلفة مليون جنيه، ومستشفي الجلاء التعليمي بتكلفة 2مليون جنيه، ومعهد الرمد التذكاري بتكلفة 4مليون جنيه، ومعهد الكبد بتكلفة 20مليون جنيه، ومستشفي المطرية بتكلفة 25مليون جنيه، ومعهد الكلي بتكلفة 2مليون جنيه. كما تم البدء في تطوير معهد شلل الأطفال بتكلفة 61مليون جنيه، ومعهد السمع والكلام بتكلفة 80مليون جنيه، ومستشفي سوهاج التعليمي بتكلفة 36مليون جنيه، ومستشفي شبين الكوم بتكلفة 14مليون جنيه، ومستشفي دمنهور التعليمي بتكلفة 135مليون جنيه، ومعهد التغذية بتكلفة مليون جنيه، ومستشفي أحمد ماهر التعليمي بتكلفة 12مليون جنيه.