كلف المجلس العسكري جهاز الأمن الوطني وهو الوجه الأخر لجهاز مباحث أمن الدولة المنحل بالبحث والتحري حول 34 شخصية سياسية وحقوقية وناشطون وردت أسمائهم في التحقيقات حول أحداث الصدام بين المعتصمين أمام مجلس الوزراء وبين قوات الجيش المكلفة بتأمين المبنى، وعلى رأسهم المهندس ممدوح حمزة والأديب الدكتور علاء الأسواني وحمدين صباحي المرشح المحتمل لانتخابات رئاسة الجمهورية والدكتور أيمن نور المرشح المحتمل لانتخابات رئاسة الجمهورية والفنان خالد أبو النجا والفنان عمرو وأكد والمخرج خالد يوسف والشيخ حازم صلاح أبو إسماعيل المرشح المحتمل لرئاسة الجمهورية وآخرين، قالت النيابة العامة أن أسمائهم قد وردت خلال التحقيقات أنهم حرضوا المتهمين على الصدام مع قوات تأمين مبنى مجلس الشعب ومجلس الوزراء وإحراق مبنى مجمع البحوث العلمية القريب من مجلس الوزراء، وذلك لإحداث فوضى وإجبار المجلس العسكري على ترك السلطة.
وبحسب مصادر فإن جهاز الأمن الوطني قد تلقى يوم الأحد 25 ديسمبر الماضي التكليف مرفق به ملف القضية المتضمن أقوال المتهمين المحبوسين على ذمة التحقيقات، وهو التكليف رقم 988 لسنه 2011 حصر أمن وطني بتاريخ 25 ديسمبر الجاري، وسوف يتم العمل عليه لتسليمه إلى مكتب النائب العام المستشار عبد المجيد محمود لضمه إلى ملف القضية الرئيسي.