وصف الدكتور محمد مهنا، مستشار شيخ الأزهر، تصريحات المفكر والباحث العلماني سيد القمني، بشأن مؤسسة الأزهر بأنها "بذاءة"، مشيرا إلى أن مثل تلك التصريحات «بلاء نُصاب به»، وأن الشعب المصري ارتضى أن يكون الأزهر مرجعيته المحلية والعالمية، «فالأزهر الشريف قبلة علمية ومرجعية عالمية ومنارة للإسلام». وقال «مهنا» خلال مداخلته الهاتفية مع الإعلامي تامر أمين في برنامج "الحياة اليوم" الذي يذاع على قناة "الحياة" أنه لا يجوز التطاول على الأزهر الشريف واتهامه اتهامات باطلة ومن يفعل ذلك جاهل وآثم، مشددًا على أن التطاول على الأزهر الشريف تطاول على الحضارة المصرية والشعب المصري كله. واشار مستشار شيخ الأزهر إلى أنه سيتم رفع دعوى ضد من يتطاول على الأزهر، خاصة أن هناك من يحاول إشاعة روح الرعب من الإسلام وهي ظاهرة الإسلاموفوبيا في الغرب والولايات المتحدةالأمريكية.