إنعكست أثار المرحلة الإنتقالية التى تمر بها مصر على العلاقات الثنائية بين البلدين، ولاسيما فى مجال التبادل التجاري، حيث شهد التبادل التجاري إرتفاعاً تدريجياً، من 2 مليون دولار فى عام 2008، إلى نحو مليار دولار، فى عام 2011 عقب قيام أذربيجان بتكرير جزء من صادراتها البترولية في معامل ميدور والعامرية، حيث يتم إستخدام جزء منه فى السوق المحلي، ويتم تصدير الجزء الآخر للسوق العالمية. وتم توقيع إتفاقية للنقل الجوي بين البلدين، في عام 1997، ثم وافقت أذربيجان عام 2009، علي منح مصر للطيران، الحرية الخامسة والخاصة للنقل بين باكو والماتي بكازاخستان، والعكس، حرصا منها علي تسيير رحلة واحدة أسبوعية للشركة كحد أدنى. كما حرص الصندوق المصري للتعاون الفني، مع دول الكومنولث، على تقديم الدعم لأذربيجان، منذ إستقلالها حيث تم تدريب نحو 1400، متدرب أذري، في عدة تخصصات، أهمها الدبلوماسية والزراعة، والأمن، ومكافحة الإرهاب، ومكافحة الجرائم المعلوماتية، والجمارك، والتجارة، والثقافة العربية، والسياحة والإعلام، والصيدلة، والهندسة الوراثية، والطب، وذلك إلى جانب الدورات التدريبية التي ينظمها المركز الدولي للزراعة. علما بأن النشاط الثقافي والتعليمي، يتم بالتعاون بين المركز الثقافي، والسفارة، ويعد أحد أهم جوانب العلاقات المصرية الأذرية، منذ نشأة العلاقات بين البلدين، وذلك في ضوء عدة أمور منها أهمية موقع أذربيجان الإستراتيجي، وقدراتها الإقتصادية، والتقارب الثقافي والإجتماعي، والتشابه في العادات والتقاليد بين شعبي البلدين. سيتم عرض أهم الأنشطة الثقافية بين مصر أذربيجان: قيام فرقة قنا للفنون الشعبية بإحياء ليالي ثقافية مصرية، بباكو عام 2008، ومشاركة مصر في مهرجان للموسيقي فى باكو عام 2009. إقامة أسبوع للفيلم المصري عامى 2009 و 2010. مشاركة فرقة أذربيجانية في مهرجان المسرح التجريبي بالقاهرة، وتنظيم الليالي الثقافية الأذرية في مصر يناير 2010. تنظيم معرض مصري للفنون التشكيلية، في أكاديمية الفنون الأذرية في إبريل 2010. نظم المركز الثقافي ندوات حول اللغة العربية، لغير الناطقين بها وندوات أدبية، في عدد من الجامعات الأذرية بمشاركة أدباء مصريين. ندوة عن إحتفالات باكو عاصمة للثقافة الإسلامية، كما شاركت مصر في مؤتمر حول حماية وتعزيز التراث 2010. مشاركة فرق مصرية وآذرية في مسابقات رياضية دولية، للمصارعة وكمال الأجسام في القاهرة وباكو. إقامة ليالي ثقافية بمناسبة إفتتاح المقر الجديد للمركز الثافي المصري، في 20 مايو 2010، بحضور وفد من وزارة التعليم العالى. زيارة فرقة بنى سويف إلى باكو، خلال الفترة في أكتوبر 2012. كذلك تطوير التعاون والصداقة بين محافظتي أبشرون والقليوبية: تم خلال الفترة الماضية تعزيز الصداقة بين محافظتي أبشرون والقليوبية، وكانت المحافظتان قد وقعتا على إتفاقية صداقة، تم بمقتضاها تبادل إنشاء حديقة للصداقة المصرية الآذرية، ومدرسة في المحافظتين، حيث تضم حديقة الصداقة المصرية الأذرية في أبشرون مجسم للأهرام، وتماثيل فرعونية، وقد تم إهداء الحديقة عدة تماثيل بعد زيارة وزير الخارجية لباكو في مايو 2010. مذكرة تفاهم بين وزارة خارجية جمهورية مصر العربية، و وزارة خارجية جمهورية أذربيجان، (8 نوفمبر 1992، القاهرة). إتفاقية التعاون الثقافي بين مصر وأذربيجان (8 نوفمبر 1992، القاهرة). البيان المشترك المصري الأذربيجاني (10 نوفمبر 1992). إتفاقية للتعاون فى المجالات القنصلية بين جمهورية مصر العربية، وجمهورية أذربيجان (7 ابريل 1994، القاهرة). إتفاقية التعاون الإقتصادي والعلمي والفني بين حكومة مصر وحكومة أذربيجان (7 ابريل 1994، القاهرة). محضر التعاون في مجال الأمور القنصلية، بين مصر وأذربيجان (7 ابريل 1994، القاهرة). محضر التعاون الإعلامي بين مصر وجمهورية أذربيجان (7 ابريل 1994، القاهرة). إتفاقية التعاون الأمني بين مصر وأذربيجان (7 مايو 1996، القاهرة). إتفاقية النقل الجوي بين مصر وأذربيجان (17 فبراير 1997، القاهرة). إتفاقية الحماية، والتشجيع المتبادل للإستثمارات بين مصر وأذربيجان (24 اكتوبر 2002، باكو). إتفاقية حول تأسيس المراكز الإعلامية الثقافية بين مصر وأذربيجان (2 مارس ، باكو 2005). محضر النوايا حول إقامة الأيام الثقافية الأذربيجانية بمصر، في شهر نوفمبر عام 2005، والأيام الثقافية المصرية بأذربيجان في شهر أبريل عام 2006، بين وزارة ثقافة مصر ووزارة ثقافة أذربيجان (29 مارس 2005، القاهرة). إتفاقية التعاون بين جامعة ناخشيوان الأذربيجانية، وجامعة القاهرة المصرية (20 ابريل 2005، القاهرة). إتفاقية التعاون الثقافي بين مصر وأذربيجان (10 نوفمبر 2005، القاهرة). إتفاقية التعاون بين وزارة مالية مصر ووزارة مالية أذربيجان (26 ديسمبر 2005، القاهرة). مذكرة تفاهم بين وزارة التنمية الإقتصادية في جمهورية أذربيجان، ومركز التجارة الدولية التابع لوزارة التجارة الخارجية والصناعة في مصر (26 ديسمبر 2005، القاهرة). مذكرة تفاهم بين وزارة صحة جمهورية مصر العربية، ووزارة صحة جمهورية أذربيجان، للتعاون في مجال الصحة والصيدلة (26 ديسمبر 2005، القاهرة). برتوكول الجلسة الثانية للجنة المشتركة للتعاون الإقتصادي، والفني، والعلمي، بين جمهورية مصر العربية وجمهورية أذربيجان (26 ديسمبر 2005، القاهرة). مذكرة تفاهم بين حكومة جمهورية مصر العربية، وجمهورية أذربيجان (21 مارس 2007، القاهرة). إتفاقية التعاون الرياضي بين جمهورية مصر العربية، وجمهورية أذربيجان (7 مايو 2007، القاهرة). محضر لإتفاقية التعاون في مجال النقل الجوي، بين مصر، وأذربيجان (7 مايو 2007، القاهرة). مذكرة تفاهم حول التعاون السياحي بين مصر، وأذربيجان (7 مايو 2007 القاهرة). إتفاقية التعاون بين وزارة العدل المصرية، ووزارة العدل الأذربيجانية (7 مايو 2007، القاهرة). إتفاقية التعاون بين وزارة الزراعة و إستصلاح الأراضي في مصر، ووزارة زراعة أذربيجان (7 مايو 2007، القاهرة). إتفاقية التعاون بين وكالة أنباء الشرق الأوسط المصرية، والوكالة التلغرافية AzerTag الأذربيجانية (7 مايو 2007، القاهرة). الإتفاقية الثنائية حول تبادل التحويل النقدي الدولي، بين الهيئة القومية للبريد المصري، والهيئة الدولية للبريد Azerpost الأذربيجاني (7 مايو 2007، القاهرة). مذكرة تفاهم حول مكافحة الجرائم بين وزارة داخلية المصرية، ووزارة الداخلية الأذربيجانية (7 مايو 2007، القاهرة). مذكرة تفاهم بين مكتبة الأسكندرية المصرية، والمكتبة الوطنية الأذربيجانية" بأخوندوف" (7 مايو 2007، القاهرة). مذكرة تفاهم بين محافظة القليوبية المصرية، ومحافظة أبشرون الأذربيجانية (7 مايو 2007، القاهرة). محضر حول التعاون الفني بين وزارة بترول مصر، ووزارة البيئة والثروات الطبيعية بأذربيجان (7 مايو 2007، القاهرة). محضر إضافي لمذكرة تفاهم حول التعاون في مجال الإتصال و تكنولوجيا المعلومات، بين وزارة الإتصال وتكنولوجيا المعلومات في مصر، ووزارة الإتصال وتكنولوجيا المعلومات في أذربيجان (7 مايو 2007، القاهرة). إتفاقية التعاون في مجال الأمور الجمركية ومكافحة المخالفات الجمركية بين حكومتي مصر وأذربيجان (29 ديسمبر2007، باكو). مذكرة تفاهم بين التلفزيون والراديو المصري، والجمعية المساهمة المغلقة للبرامج التلفزيونية، والراديو في جمهورية أذربيجان (29 ديسمبر2007، باكو). محضر حول التعاون بين المكتبة الوطنية ودار الأرشيف، في مصر، ومعهد المخطوطات التابع لأكاديمية العلوم الوطنية في أذربيجان (29 ديسمبر2007، باكو). محضر حول تأسيس مركز الأبحاث العلمية المصرية الأذربيجانية، بين وزارة الزراعة وإستصلاح الأراضي في مصر وأذربيجان (29 ديسمبر2007، باكو). مذكرة تفاهم حول الحرية الخامسة بين وزارة الطيران المدني، في مصر، وسلطة الطيران المدني في أذربيجان ( 10 مارس 2009، القاهرة) . مذكرة تفاهم بين الهيئة المصرية العامة للبترول، والشركة الوطنية الأذربيجانية للنفط (سوكار) في نوفمبر 2016، واتشمل المذكرة التعاون والمشاركة في تنفيذ العديد من المشروعات البترولية على المدى الطويل حيث تم الاتفاق على تي تشمل على توريد سوكار كميات من الخام، تصل إلى مليوني برميل زيت خام، للتكرير بمعملى ميدور والنصر للبترول والتعاون فى مجال الغاز المسال والبنية التحتية، فضلاً عن التعاون فى مجال البتروكيماويات وتطبيق نظام المبادلات بين الخام والمنتجات البترولية. مستشار بالسلك الدبلوماسي الأوروبي والمستشار الإعلامي والثقافي بسفارة جمهورية أذربيجان