أكد الدكتور هاني هلال وزير التعليم العالي والبحث العلمي أن هذا الحادث موجه لبث الفتنة الطائفية في مصر واتهم الجهات الخارجية بالتخطيط للحادث للوقيعة بين المصريين ،وقال أن الانفجار استهدف المسلمين والمسيحيين وأعرب عن شعور كل المصريين بالحزن وقال انه يعزي البابا شنودة وأسر الضحايا من أقباط ومسلمين وطالب الجميع بضبط النفس للتغلب علي هذا الحادث. وقال أمين أباظة وزير الزراعة أنه لايجب أن نفسر هذا الحادث علي أنه وقع لمجموعة وليس للمصريين جميعا وأضاف "شعورنا بالألم والجرح يتساوي مع المسيحيين في هذا ، فنحن كمصريين شعرنا كلنا بهذا الحادث ونال منا بنفس الطريقة ونفس التأثير ،ووجودنا هنا في زيارة قداسة البابا ليس لأنه الأب الروحي للمسيحيين ولكن لأنه جزء من هذا الشعب مثلنا وكلنا نعزي بعضنا ،لأن كلنا علي نفس المستوي من الشعور بالألم في تصريحات لبرنامج صباح الخير يامصر الاثنين. كما صرح الدكتور أحمد درويش وزير التنمية الادارية أننا امام قضية فكر في المقام الأول وهوفكر خاطيء ،وأسلوب يحاول به أن يغسل عقول بعض الشباب ،ورأيي أن الفكر لا يواجه الا بالفكر حتي لا يجد هؤلاء بع ذلك شخص يستطيعون تجنيده فمطلوب من وسائل الاعلام والمؤسسات الثقافية ومؤسسات التعليم علي المدي القصير بالتصدي لهذا الفكر بالفكر حتي نستطيع الخروج من هذه الأزمة.