أكدت إدارة الدعوة بوزارة الأوقاف، أن معاهد الجمعية الشرعية لإعداد الدعاة والقرآن الكريم لا تعمل تحت مظلة الأزهر الشريف ولا الأوقاف، وأن تلك المعاهد مازالت تدرس مناهج ليست لها علاقة بالأوقاف، مؤكدة أن بعض من يُدرّسون بهذه المعاهد من غير الأزهريين، وبعضهم يُدرّس في غير تخصصه، وبعضهم محسوب علي تيارات متشددة أو لا يتبني الفكر الوسطي الأزهري.