أمرت نيابة ناصر، برئاسة المستشار مصطفي خليل، وإشراف المستشار تامر الخطيب، المحامي العام لنيابات بني سويف، بانتداب لجنة هندسية من هيئة السكة الحديد، لفحص قطار البضائع الذي اصطدم بالصدادة الخرسانية المخصصة للتخزين، وبيان مدي سلامة أجهزته، وتحديد سرعة السائق وقت وقوع الحادث، وبيان تلفيات القطار والمحطة.. كما أمرت النيابة بالتحفظ علي سائق القطار ومساعده ومراقب البرج، لحين استكمال التحقيقات.. كان سائق القطار وملاحظ البرج قد تبادلا الاتهامات امام النيابة.. قال محسن تهامي، سائق قطار البضائع الذي اصطدم بصدادة التخزين إنه لم ينبه عليه بالتخزين من محطة بني سويف وحتي محطة ناصر، حتي يقوم بإدخال القطار لقضبان التخزين.. وأضاف أن السيمافورات كانت معدة أمامه للطريق الطوالي وليس التخزين وفوجئ بالصدادة الخرسانية أمامه.