قال الشيخ جمعة محمد علي إنه إذا حكم مصر شخص غير منتمٍ للمؤسسة العسكرية المصرية، فإن حكمه سيفشل، لأن هذه المرحلة تحتاج رجلًا قويًا ذا خبرات عديدة، ولا تتوفر هذه الصفات في حاكم مدني من الأسماء المطروحة على الساحة. وطالب جمعة خلال خطبة ألقاها بميدان التحرير، المشير عبد الفتاح السيسي الخروج بخطاب رسمي، لإعلان ترشحه لرئاسة الجمهورية، وإصدار قرار جمهوري بالعفو عن جميع المعتقلين من شباب الثورة، لفتح ملف إدخال الشباب في الحياة السياسية والعامة.
ووجه نصيحة للرئيس المقبل، قائلاً: "عليك الابتعاد عن كل من احترف السياسة طوال 60 عامًا مضى، وعليك بالشباب".