طالبت الجماعة الإسلامية علي ضرورة انتظام العملية التعليمية ، وأن تتكاتف الجهود للحفاظ على أبنائنا ضد أي تهديد محتمل أو مصطنع من قبل بعض الجهات التي تريد إشعال الموقف لتثير الذعر وتلفق التهم الجاهزة لمعارضي ما أسموه ب"الإنقلاب". كما أكدت الجماعة الإسلامية خلال بيان لها الجمعة 20 سبتمبر، على الحق القانوني والدستوري للطلبة في الإعتراض السلمي على ممارسات سلطات ما أسموه ب" الإنقلاب العسكري" . وأوضح الجماعة خلال البيان أنه لا تعارض مطلقا بين انتظام العملية الدراسية وبين حق الطلاب في التظاهر السلمي ضد ما أسموه "الإنقلاب العسكري"، وتأييدا للشرعية .