كشف مصدر مسئول بالجهاز المركزي للمحاسبات، أنه تم رفع تقرير لرئاسة الجمهورية عن منظومة النقل البحرى والنهرى والجوى، وكشف التقرير عن أن انخفاض عدد الوحدات الناقلة للإنتاج الكمي للخطوط الملاحية عام 2012 - 2013 إلى 5258 وحدة مقابل 5916 وحدة عام 2011 - 2012، وانخفاض كمية البضائع المنقولة إلى نحو 1.661 مليون طن عام 2012 - 2013 مقابل نحو 1759 مليون طن عام 2011 - 2012، وذلك بمنظومة النقل النهري، فضلا عن عدم وجود ملاحة نهرية ليلية لعدم تجهيز وسائل إنارة وإرشادات كافية وعدم توافر محطات وقود نهرية. وأشار المصدر إلى أن التقرير شمل النقل الجوي والذي يشمل الشركة القابضة لمصر للطيران والشركة المصرية القابضة للمطارات والملاحة الجوية والشركات التابعة لهما، إذ كشف التقرير عن تحقيق خسائر متتالية منذ عام 2010 - 2011، بلغت نحو 7.5 مليارات جنيه وتحقيق معظم خطوط الشركة لخسائر تشغيل.