أثارت تصريحات الدكتور أشرف الشيحي، وزير التعليم العالي والبحث العلمي، بخصوص إجراء انتخابات اتحاد طلاب مصر على لائحة 2007، على هامش مؤتمر علمي عن الإنجاز والابتكار، جدلا بين رؤساء اتحادات طلاب الجامعات المنتخبين والقوي الطلابية، خوفا من الاتجاه إلى تجميد مجلس اتحاد طلاب مصر المنتخب يوم 10 ديسمبر الماضي، حيث ذكر الوزير أن الانتخابات تمت وفقا للائحة 2007، وليس علي تعديلا لائحة 2014، وما هو ما يبطل انتخابات اتحاد طلاب مصر. لائحة 2007 لا تحتوي لائحة 2007 علي أي مواد تذكر وجود هيكل تنفيذي لمجلس اتحاد طلاب مصر، أو هيئات عليا، وكذل لجان عامة من الأساس، وبالتالي فإن الانتخابات التي أجريبت في معهد إعداد القادة باطلة، ويجب تجميد نشاط المجلس المنتخب وعدم الإعتراف بقانونيته. لائحة 2013 أعلنت وزارة التعليم العالي عن تعديل بعض مواد اللائحة المالية والإدارية للاتحادات الطلابية الصادر عام 2014، وذلك طبقًا للقرار الوزاري رقم 4307 لسنة 2015 بتاريخ 18 أكتوبر 2015؛ وجاء نص التعديل الذي تم نشره بالجريدة الرسمية في عدد 20 أكتوبر بخصوص مجلس اتحاد طلاب مصر في المادتين 13 و14 المادة الثالثة عشر: تجرى انتخابات اللجان العليا لاتحاد طلاب مصر من بين الأمناء والأمناء المساعدين للجان اتحاد طلاب الجامعات المصرية الحكومية وتجرى الانتخابات الخاصة برئيس ونائب رئيس اتحاد طلاب مصر من بين رؤساء ونواب رؤساء الاتحادات الطلابية بالجامعات المصرية الحكومية تحت إشراف اللجان المشكلة للإشراف على الانتخابات. المادة الرابعة عشر: يشكل المكتب التنفيذي لاتحاد طلاب مصر من، رئيس اتحاد طلاب مصر "رئسيًا"، ونائب رئيس اتحاد طلاب مصر "نائبًا"، وأمناء اللجان العليا لاتحاد طلاب مصر "أعضاء"، ورئيس اتحاد طلاب جامعة الأزهر "عضوًا"، ورئيس اتحاد طلاب المعاهد العليا "عضوًا"، وممثل عن طلاب الجامعات الخاصة "عضوًا". التعليم العالي تنفي من جانبه، نفي محمد حجازي، المستشار الإعلامي لوزارة التعليم العالي، ما تردد عن إجراء انتخابات اتحاد طلاب مصر على لائحة 2007، وأن كافة إجرائها تمت علي لائحة 2014 وتعديلاتها، مؤكدا أن ما تردد أخيرا عن نية وزارة التعليم العالى فى إلغاء الانتخابات مجرد مبالغات وشائعات لاصحة لها مطلقا. وأضاف حجازى فى تصريحات صحفية، أن اللجنة العليا المشرفة على الانتخابات الطلابية ستنظر الطعون المقدمة لها وبعدها تعلن قرارها وبعد ذلك سيتم رفع التقرير للدكتور أشرف الشيحى وزير التعليم العالى والبحث العلمى لاعتماد القرار، مشير إلي أن اللجنة تدرس الطعون حاليا، وأنها طلبت عدد من البيانات من بعض الجامعات للنظر فى هذه الطعون وكذلك بعض القضايا المرفوعة بشأن هذه الانتخابات.