أقام البابا شنودة بابا الإسكندرية وبطريرك الكرازة المرقسية طعناً أمام المحكمة الإدارية العليا لإلغاء حكم القضاء الإداري بتأييد قرار محافظ القاهرة بايقاف أعمال البناء دون ترخيص بكنيسة القديسة العذراء مريم بحي الشرابية. قال البابا: إن القرار الصادر بوقف بناء الدور الأرضي بمسطح 360م2 بالمبني البحري بالكنيسة يخالف المادة 46 من الدستور، التي تؤكد حرية العقيدة وممارسة الشعائر الدينية.. كان حي الشرابية قد أصدر قراراً بترميم المبني البحري بالكنيسة إلا أن الكنيسة قامت بهدم المبني وبنائه بالهيكل الخرساني بدون ترخيص وأصدر محافظ القاهرة ورئيس حي الشرابية قراراً بايقاف العمل بالمبني.