أصدر مجلس إدارة الهيئة القومية لضمان جودة التعليم والاعتماد أصدر قراراً مع بداية عام 2016 م باعتماد كلية الهندسة بجامعة المنصورة لتنضم الى الكليات المعتمدة بالجامعة وبذلك يصبح عدد الكليات المعتمدة بالجامعة سبعة كليات هي: الطب، الصيدلة، العلوم، التربية الرياضية، التمريض والزراعة، الهندسة. يأتي اعتماد كلية الهندسة في اطار الخطة الاستراتيجية التي وضعها الأستاذ الدكتور محمد القناوي رئيس الجامعة و تنفيذها مرحليا لتطوير منظومة الأداء بجامعة المنصورة لإعداد خريج قوي ينافس في سوق العمل المحلي والإقليمي والدولي من خلال اعتماد عدد من كليات الجامعة خلال عام 2015 م وتم اعتماد كلية الزراعة وقد تحقق اعتماد كلية الهندسة مع بداية عام 2016 وفق برنامج العمل الزمنى لاعتماد العديد من الكليات داخل الجامعة. كما تعمل الجامعة حاليا لتنفيذ الخطة الاستراتيجية لعام 2016 وتكرس جهودها لاعتماد عدد من الكليات منها: طب الأسنان، الحقوق، الطب البيطري.