اثار ترشح السيسى العديد من الجدل بين احزاب مختلفة فى مصر ورفض البعض منهم لهذا القرار الذى لم يعلن رسمى حتى الان منهم التحالف الوطني لدعم الشرعية ورفض الانقلاب وأحزاب وحركات ترشيح وزير الدفاع عبد الفتاح السيسي معتبرة أنه ضد ثورة يناير أو بسبب فشله في إدارة الملف الأمني في حين رحبت أخرى بالترشيح معتبرة أنه تلبية لما سمته نداءات شعبية متكررة . فقد اعتبر عمرو عادل القيادي في التحالف الوطني لدعم الشرعية ورفض الانقلاب إعلان ترشح السيسي تأكيدا على أن ما حدث في 3 يوليو انقلاب عسكري كامل الأركان. وأكد محمد المهندس عضو الهيئة العليا لحزب مصر القوية أن ترشيح المشير السيسي قفز على مطالب ثورة يناير. ورفضت حركة طلاب 6 أبريل ترشيح السيسي ليس بسبب كونه رجلا عسكريا فحسب، ولكن لفشله في إدارة الملف الأمني. على الجانب الآخر، قالت حركة تمرد إنها تعتزم توزيع ورقة أخرى على المواطنين لمعرفة مطالبهم من المشير. واعتبر حزب المصري الديمقراطي الاجتماعي تلك الخطوة بالمتوقعة والإيجابية. أما حزب المصريين الأحرار فاعتبر ترشيح السيسي خطوة لاستكمال ما جاء في بيان المجلس الأعلى للقوات المسلحة وطمأنة لمؤيديه. واعتبر حزب الدستور ترشح السيسي حديث تشويق وإثارة للمواطنين وتلبية لنداءات شعبية متكررة منذ 30 يونيو. فيما رأى القيادي في حزب التجمع حسين عبد الرازق أن مواقف السيسي تُنصِّبه رئيسًا للجمهورية بالتزكية.