يقوم د. مصطفى مسعد وزير التعليم العالي حاليا بإعداد تقرير شامل عن مكتبة الإسكندرية؛ وذلك بتكليف من د. هشام قنديل بعدما تقدم ياسر عبد الرافع عضو مجلس الشعب بالإسكندرية بطلب إحاطة للجنة الثقافية بالبرلمان حول الفساد في المكتبة، مطالبا بإقالة الدكتور إسماعيل سراج الدين من رئاسة مجلس أمناء المكتبة. وقالت مصادر إن المكتبة تتبع مؤسسة الرئاسة طبقا لقانون 1 لسنة 2001 الخاص بعمل مكتبة الإسكندرية والذي ينص على أن رئيس الجمهورية هو الذي يرأس مجلس أمناء المكتبة. وأشارت المصادر إلى أن هناك أنشطة تنظمها لجنة مركز دراسات الديمقراطية والسلام الاجتماعى بالمكتبة تمثل خطرا على الأمن القومي المصري ؛ حيث تتم بتدخل أمريكى مباشر – وفقا للمصادر. كانت نقابة العاملين بمكتبة الإسكندرية قد طالبت بإقالة الدكتور اسماعيل سراج الدين، فى خطاب رسمى إلى الرئيس محمد مرسى بصفته رئيس مجلس أمناء مكتبة الإسكندرية، طبقا لقانون رقم (1) لسنة 2001. وأوضحت مصادر بالنقابة لجريدة الحرية والعدالة ان هناك أوضاعا مريرة تعيشها مكتبة الإسكندرية، تحت وطأة الإدارة الحالية المنتمية إلى الحزب الوطني شكلا ومضمونا.