اكدت مصادر داخل مؤسسة الرئاسة ل"الوادي" أن الرئيس محمد مرسي اتصل بالدكتور محمد بديع، المرشد العام لجماعة الإخوان المسليمن، ولاول مرة منذ تولى الدكتور محمد مرسى رئاسة الجمهورية ودخوله قصر الاتحادية. وأشار المصدر أن المكالمة كانت بسبب استياء الرئيس الشديد من تدخلات المهندس خيرت الشاطر وتصريحاته الإعلامية التى تحرج الرئيس مرسى وكان أبرزها ازمة برنامج النهضة التي أكد فيها الشاطر عدم وجود فعلى لمشروع النهضة، واضاف المصدر ان المكالمة ايضا تطرقت إلى تدخلات الشاطر فى محاولة حل بعض المشاكل الموجودة والتى يعانى منها الشعب المصرى ولكنها تتعارض مع حلول مؤسسة الرئاسة والحكومة الأمر أيضا الذى يحرج الرئيس مرسى، مؤكداً أن الرئيس وضح عليه علامات الغضب من المهندس خيرت الشاطر نظراً لتدخلاته الشديدة فى أمور عدة معلنه وغير معلنة. ويعد هذا أول خلاف واضح بين الرئيس مرسى والمهندس خيرت الشاطر المرشح الاول لرئاسة الجمهورية عن حزب الحرية والعدالة.