قال الدكتور محمد مرسي رئيس الجمهورية في تدوينة له علي تويتر تعليقاً علي حادث قطار أسيوط إنه تابع وبكل الآسي والحزن منذ الصباح الباكر ما وقع صباح اليوم من حادث أليم. و تقدم مرسي بالأصالة عن نفسه وبالنيابة عن الشعب المصري كله بخالص العزاء والمواساة لأسر وأبناء الضحايا والمصابين في هذا الحادث الأليم. و قال مرسي إنه قرر الاتي قبول استقالة وزير النقل ورئيس هيئة السكة الحديد، وتحويل المسئولين إلى النيابة العامة للتحقيق وسرعة الانجاز في التحقيقات لمعرفة المتسبب في هذا الحادث الأليم. وقرر اتخاذ كافة الاجراءات من جميع الجهات التنفيذية المعنية لتعويض أسر الضحايا والمصابين وتذليل كافة العقبات لهم. وأكد مرسي أنه سيحاسب المسئولين عن هذا الحادث وأنه كلف رئيس الوزراء هشام قنديل بالتحرك إلى موقع الحادث واتخاذ اللازم.