يعتقد البعض أن خل التفاح مفيد لجسم الإنسان ويساعد على إنقاص الوزن؛ لذلك نصح الدكتور أحمد صبري أخصائي السمنة، بعدم الإكثار من تناول خل التفاح بكثرة لأن له أضرار كثيرة لا يعلمها البعض وهي: 1-إن تناول خل التفاح يؤثر كثيراً على المعدة ويؤدي إلى حدوث تقرحات والتهابات عديدة في المعدة. 2-مرض البواسير يعد من إحدى الأضرار المزمنة التي يسببها تناول خل التفاح. 3-الإصابة بتهيجات قوية ومؤلمة في القولون. 4-التعرض للإصابة بتقرحات وآلام في المريء أيضاً تعد من الأضرار الناتجة عن تناول خل التفاح. 5-الإصابة بارتداد في المعدة وعودة الطعام المتناول نحو المريء مما يؤدي إلى حدوث حموضة عالية في المريء وبالتالي الشعور بآلام قوية. 6-الإصابة بالتهاب في القولون أيضاً من الأضرار الناتجة عن تناول خل التفاح. الإصابة بقرحة في الاثني عشر.