رغم إعلان القائمقام البطريركي الأنبا باخوميوس، مطران البحيرة، وقوف الكنيسة على مسافة واحدة من المرشحين، وعدم توجيه شعب الكنيسة لانتخاب مرشح بيعنه، رصد مراقبى تحالف "حرة نزيهة" الذى ينسق له مركز "ابن خلدون" وتحالف "شارك وراقب" الذى ينسق له جمعية التنمية الإنسانية، قيام بعض كنائس محافظة قنا في مركز "بندر قنا" بتوجيه الأقباط هناك للتصويت لأحمد شفيق، من كنائس مارمرقس، مارجرجس، السيدة العذراء، القديسة دميانة والبطرسية شرق السكة ببندر قنا. وقالت هدى نعيم المراقبة بالحملة ل "الدستور الأصلي"، إن الأب صليب أخنوخ من الكنيسة البطرسية قام بتوجيه الناخبات القبطيات للتصويت لشفيق فى لجان "المعهد الدينى"، وهى لجان سيدات فقط. مضيفة أنه قام بحشدهم بميكروباصات للتصويت، وقيام بعض الشباب بالحشد لصالح شفيق بتوجيه كنسى، مما جعل الإسلاميين ينشطون في المقابل لهم.
وأشارت إلى أن الجنة رقم 31 سيدات بنفس المعهد، يسمح القاضى للناخبات المنقبات بالتصويت فى وجود مساعدة من إحدى موظفات اللجنة، مضيفة إنهن يتبادلن بعض الورق أثناء التصويت.
وأضافت أن أنصار حملة عبد المنعم الفتوح قاموا بتوزيع دعاية له أمام لجان "المعهد الدينى".