أدان تقرير الجهاز المركزي للمحاسبات شركة " مطاحن شرق الدلتا " ، لافتًا أن الشركة لم تنتهي من تسجيل ونقل الملكية لبعض أراضي الشركة التي آلت إليها بالتأميم و وضع اليد ، والبالغ مساحتها نحو 32 ألف متر مربع ، 95 ألف متر مربع على الترتيب . كما لم يتم تسجيل أرض شونة السلام ببلبيس منذ تحرير العقد الابتدائي لها في 15 أكتوبر 2000 و البالغ مساحتها 47 ألف متر مربع ، رغم ما أوصت به الجمعية العامة للشركة بجلستها المنعقدة في 19 أكتوبر 2009 نحو سرعة الانتهاء من تسجيل ونقل المكلية لتلك الأراضي . و أدان التقرير الشركة في أنها لم تقم بحسم النزاع بين الشركة ومحافظة دمياط بشأن تعويض الشركة عن قطعة الأرض البالغ مساحتها نحو 2300 متر مربع ، بمنطقة السيالة و المنزوع ملكيتها للمنفعة العامة منذ عام 2005 ، كما لم يتم حسم الخلاف عن حق الانتفاع السنوي لأرض شونة شطا التي تم تخصيصها للشركة بموجب قرار محافظ دمياط رقم 147 في 23 مايو 2005 مقابل نزع ملكية أرض السيالة . وكانت نتائج أعمال الشركة خلال العام المالي 2009-2010 قد أظهرت تحقيق صافى ربح بلغ 25.498 مليون جنيه بتراجع قدره 25.2% مقارنة بصافى ربح بلغ 34.081 مليون جنيه خلال الفترة المقارنة من 2009 .