احتلت جامعة الزقازيق الترتيب رقم 594 عالميا و 7 مصريا وفقا لتقرير SCIMAGO INSTITUTIONAL RANKINGS لعام 2016 والمبنى على قاعدة بيانات SCOUPS والخاص بتقييم البحث العلمى فى مؤسسات التعليم العالى وعددها 5147 . صرح الدكتور خالد عبدالباري، رئيس جامعة الزقازيق، بأن التقييم يتم على عدد الأبحاث الدولية المنشورة فى مجلات دولية مفهرسة وعدد الإشارات المرجعية لتلك الأبحاث والعديد من العوامل الأخرى التى تقيس كفاءة البحث العلمى فى مؤسسات التعليم العالى.