أكد الدكتور ياسر علي القائم بأعمال المتحدث الاعلامي باسم رئيس الجمهورية أن سوء الفهم بين مؤسسة الرئاسة وشيخ الأزهر قد انتهي تماما بالاتصال الذي أجراه الرئيس محمد مرسي مع الدكتور أحمد الطيب، مؤكدا على تقدير الرئيس لمشيخة الأزهر. وكان الإمام الأكبر شيخ الأزهر الدكتور أحمد الطيب قد تلقى اتصالا هاتفيا اليوم الثلاثاء، من الرئيس محمد مرسي، أبدى خلاله تقديره واعتزازه بالأزهر الشريف وشيخه وهيئة كبار العلماء فيه، معربا عن استيائه البالغ من تصرف القائمين على بروتوكول رئاسة الجمهورية خلال احتفالية جامعة القاهرة. وأضاف بيان للازهر اليوم الثلاثاء، أن الرئيس أشاد بالدور المتميز للأزهر على المستوى الوطني والإسلامي والعالمي، والذي يجسِّد سماحة الإسلام وعظمته ووسطيته. من جانبه، أعرب الطيب خلال الاتصال التليفوني عن شكره وتقديره للسيد رئيس الجمهورية، متمنيا له التوفيق وأن يسدد الله خطاه في جمع المصريين على كلمة سواء؛ حتى نتفرَّغ جميعًا للعمل والبناء واستكمال أهداف الثورة.