كان محمد الأمين باي وليا للعهد في تونس في بداية فترة حكم المنصف باي خلال الحرب العالمية الثانية، وكان قد تم احتلال تونس من قبل قوات المحور واتخذ المنصف باى مواقف سياسية تعيد الاعتبار للسلطة التونسية وللمصالحة بين القصر والشارع، فحرصت السلطات الفرنسية على إزاحته، وتم الاتصال بولى عهده محمد الأمين لخلافته «زي النهاردة» في 5 مايو 1943، واعتلى الأمين عرش تونس في الخامس عشر من نفس الشهر ونتيجة ذلك اعتبر حكمه فاقدا للشرعية. قضى «باي» السنوات الأولى من حكمه مرفوضا من الحركة الوطنية كما اقتصر دوره على التوقيع على الأوامرالتى تعرض عليه من سلطات الحماية، وكانت قد تشكلت في عهده 7 وزارات، كان آخرها وزارة الحبيب بورقيبة من 9 إبريل 1956 إلى 25 يوليو 1957، والتي جاءت على يدها نهاية العهد الملكي في تونس. وبعد وفاة فرحات حشاد أمين عام الاتحاد العام التونسى للشغل، والذى كان أقرب الزعماء إلى القصر الملكى دخل صالح بن يوسف، الأمين العام للحزب الحر الدستورى الجديد، في صراع مفتوح مع الحبيب بورقيبة فانتهى الأمر بإزاحة بن يوسف ثم حصلت البلادعلى استقلالها في 20 مارس 1956. وفي أغسطس 1956كان بورقيبة قد أجبر «باي» على التخلي عن بعض أملاكه للدولة ثم اتخذ المجلس القومي التأسيسي قرارا بإلغاء النظام الملكى وإعلان النظام الجمهوري يوم 25 يوليو 1957، ووضع الأمين باي وعائلته رهن الإقامة الجبرية ثم أخلى سبيله في أكتوبر 1960 لينتقل للعيش في شقة بحي لافيات حتى يوم وفاته في 30 سبتمبر 1962.
