أصدر الدكتور عصام فايد، وزير الزراعة واستصلاح الأراضي، قرارًا وزاريًا حمل رقم 2052 لسنة 2015، بتبعية مستشفى الزراعيين لوزارة الزراعة واستصلاح الأراضي، على أن تقوم بأداء الخدمة لكافة العاملين بوزارة الزراعة ومراكز البحوث وكافة الجهات التابعة للوزارة، وذلك طبقًا للتعديل في النقابة العامة للأطباء من تعديل اسم صاحب التسجيل من صندوق الرعاية الصحية بوزارة الزراعة إلى وزارة الزراعة واستصلاح الأراضي في 1/2/2015. وتضمن القرار الوزاري أن تخضع المستشفى للرقابة المالية قبل الصرف من طرف وزارة المالية وبعد الصرف من الجهاز المركزي للمحاسبات.