اتهم الدكتور ياسر برهامي، نائب رئيس مجلس إدارة الدعوة السلفية، جماعة الإخوان المسلمين بعملها على تحجيم الدعوة السلفية في مصر، ورغبتها في تهميش دورها، واعتبر في تصريحات لإحدى القنوات التليفزيونية أن الإخوان يسعون للسيطرة على المشهد السياسي. وأيدت بعض قيادات حزب النور السلفي تصريحات برهامي مطالبة بضرورة أن يتم استيعاب أي خلافات تقع بين فصائل التيار الإسلامي المختلفة سعيًا لإنجاح المشروع الإسلامي في الحكم، وأكدت القيادات ضرورة أن يحدث تفاهم بين الدعوة السلفية والإخوان لإنجاح الطرفين. ومن جانبه أكد رفعت سليمان، القيادي بحزب النور بمحافظة سوهاج، وجود رغبة قوية لدى جماعة الإخوان المسلمين لتهميش دور الدعوة السلفية، مشددًا على أن تلك الرغبة جاءت من رغبتهم فى الاستئثار بالمشهد الحالى. وتابع متحدثًا ل"المصريون" أن جماعة الإخوان تسعى للسيطرة على جميع مفاصل الدولة سواء كان التابعة للسلطة السياسية أو الدعوة الدينية. وأشار إلى أن تهميش الإخوان للدعوة السلفية يأتي من سعيهم لسيادة المنهج الإخواني ورفض الخط السلفي الذي يتزعمه حزب النور والدعوة السلفية. ووصف سليمان هذه الرغبة لدى الإخوان المسلمين ب"المؤكدة" و"الطبيعية" مضيفًا أنهم لن يفلحوا ففي ظل النظام السابق كان النظام يقمعهم ورغم ذلك كان لهم تواجد فى الشارع". وحذر سليمان من استمرار الإخوان فى تلك الخطوات حتى لا ينعكس الخلاف على المشروع الإسلامي في مجمله. واستشهد سليمان على رأيه بمشروع قانون تقدم به حزب الحرية والعدالة الذراع السياسية لجماعة الإخوان المسلمين إلى مجلس الشعب السابق، يقصر العمل بالدعوة على مشايخ الأزهر. واعتبر سليمان أن هذا القانون لو تم إقراره سيمنع الكثير من مشايخ السلفية الذين هم بالأساس خريجو كليات مختلفة ثم تخصصوا فى مجال الدعوة من استكمال عملهم رغم قدرتهم وثقلهم الدينى. وأوضح أن القانون بهذا الشكل الذي تحمس إليه الحرية والعدالة كان بإمكانه أن يمنع الشيخ محمد حسان والشيخ أبو إسحق الحويني من الدعوة رغم مكانتهما الدينية ورصيدهما الكبير في مجال الدعوة. وعلى الجانب الآخر اعتبرت قيادات داخل حزب النور أن الحديث عن ترصد الإخوان المسلمين للدعوة السلفية أمر يجب تخطيه لمصلحة التيار الإسلامي ككل، وقال جمال منصور قيادي بحزب النور بمحافظة المنوفية، إن كلاً من الإخوان المسلمين والدعوة السلفية يسعيان لمصلحة الدين على اختلاف أساليبهما وأساسهما الأيدلوجي. وأضاف أنه حتى لو كان الإخوان يريدون تحجيم التيار السلفى فى مصر فهذا أمر لا يجب أن يخيف السلفيين، مشيرًا إلى أن التيار السلفي في مصر عانى طوال السنوات السابقة من النظام السابق، ورغم ذلك لم يتمكن أحد من إفشاله. وأكد أن الدعوة السلفية تتمتع بقوة فى الشارع ولا تريد أن تدخل في خلاف مع أي فصيل سياسي خاصة لو كان يحسب على الإسلام السياسى.